El problema no está en en "Dios" o en la religión como tal, simplemente el ser humano es imperfecto, ambicioso, prepotente y tiende a enrollarlo todo xD
Inclusive si las religiones fuesen dejadas de lado en menos de 100 años veríamos las mismas guerras de siempre entre bandos por saber quien tiene la razón verdadera y por consiguiente quienes son "los mejores" (De hecho en la serie South Park se hizo una serie de capítulos abordando este tema pero con tintes humorísticos claro está)
Creo que cada religión que sea benigna y tolerante para con otras y con lineas de pensamiento diferentes merece existir para que cada quien con su propio libre albedrío y libertad decida unirsele o lo contrario.
Saludos!