Ich halte es für äußerst unwahrscheinlich, dass Nietzsche Atheist war.
Habe gerade mal kurz recherchiert und auch gleich jemanden gefunden, der wohl nach intensiver Forschung zu dem gleichen Ergebnis kommt:
https://www.suedostschweiz.ch/zeitung/war-nietzsche-wirklich-ein-atheist