La cosa che da sempre mi piace della stampa 3D è che può davvero interessare chiunque perchè è uno strumento semplice che permette di plasmare le proprie idee, i propri progetti, i propri sogni!
In merito alla tua domanda le risposte possono essere sostanzialmente due:
si puo impostare un cambio filamento durante la stampa per cambiare colore e si puo anche stampare a più con una stampante a doppio estrusore
si puo stampare un oggetto a colori ( in quadricromia) con delle apposite stampanti non a filamento (FDM) ma con un sistema diverso.
Troverai utile a tal proposito il mio primo articolo sulla stampa 3D dove spiego tutto nel dettaglio!